Общефедеральный список "Яблока" на выборах в Государственную Думу второго созыва возглавили Г.Явлинский, В.Лукин и Татьяна Ярыгина. В проходную часть списка был включен бизнесмен Михаил Юрьев, финансировавший избирательную кампанию "Яблока".
         17 декабря 1995 "Яблоко" собрало 4.767.384 (6,89%) голосов избирателей, заняв 4-е место и получив в новом составе Государственной Думы 31 мандат по пропорциональной системе плюс 14 мандатов в мажоритарных округах. Во фракцию "Яблоко во Второй Государственной Думе вошло 46 депутатов: 31+14+1 депутат, избранный как независимый (Петр Шелищ).
         Наибольшую поддержку на выборах 19 декабря 1995 "Яблоко" получило в Камчатской области (20,43%, 1-е место), в Санкт-Петербурге (16,03%, 1-е место), Москве (14,31%, 3-е место), Ростовской области (14,11%, 2-е место после КПРФ), Ярославской области (11,69%, 2-е место), Московской области (10,99%, 3-е место), Мурманской области (10,63%), Нижегородской области (10,56%).
         В Думе второго созыва "Яблоко", в соответствии с т.н. "пакетным соглашением", получило должность одного из заместителей председателя Думы (М.Юрьев), 4 поста председателей комитетов (Комитет по международным делам - В.Лукин; Комитет по бюджету, налогам, банкам и финансам - М.Задорнов; Комитет по экологии - Тамара Злотникова; Комитет по природным ресурсам и природопользованию - Алексей Михайлов) и по одному заместителю председателя в остальных 24-х комитетах.

      27-28 января 1996 состоялся III съезд Общественного объединения "Яблоко", на котором был избран новый состав Центрального Совета, заместителями председателя "Яблока" избраны В.Лукин и Сергей Иваненко. На пленуме Центрального Совета 18 февраля 1996 было избрано бюро ЦС из 12-ти человек. Съезд "Яблока" выдвинул кандидатуру Г.Явлинского в президенты России.
         На выборах губернатора Санкт-Петербурга весной 1996 года лидер Региональной партии Центра (РПЦ) - Санкт-Петербургского отделения "Яблока" Игорь Артемьев был зарегистрирован кандидатом, но накануне 1-го тура снял свою кандидатуру в пользу Владимира Яковлева. РПЦ-"Яблоко" поддержало В.Яковлева и после его победы во втором туре И.Артемьев был назначен одним из двух первых вице-губернаторов (по финансовым вопросам).
         В первом туре президентских выборов 16 июня 1996 Г.Явлинский получил 5 550 752 голосов или 7,34% (четвертое место после Бориса Ельцина, Геннадия Зюганова и Александра Лебедя).
         Между первым и вторым турами президентских выборов в конце июня 1996 прошел IV съезд "Яблока". Как голосовать ("против всех" или за Ельцина) было предложено решать региональным организациям самостоятельно, а фактически - оставлено на личное усмотрение (справочное голосование делегатов съезда дало 57% голосов за позицию "против всех", и 41% - в поддержку Ельцина).
         После президентских выборов "Яблоко" неизменно находилось в оппозиции к правительству Виктора Черномырдина и голосовало против бюджета.
         На V съезде 30 ноября - 1 декабря 1996 было принято решение о постепенной трансформации в партию. Избран новый состав ЦС, количество заместителей председателя увеличено до трех (первый заместитель - В.Лукин, заместители - С.Иваненко и В.Игрунов).
         В ноябре 1997 года в связи с вхождением в правительство Виктора Черномырдина прекратил свое членство в "Яблоке" М.Задорнов, в апреле 1998 перестала быть членом "Яблока" Оксана Дмитриева (по той же причине).
         На выборах в Московскую городскую Думу в декабре 1997 "Яблоко" провело 4 своих кандидатов (в Московской Думе - 35 мест), из них двое входили в неофициальный рекомендательный "список мэрии".
         14-15 марта 1998 в подмосковном пансионате "Отрадное" прошел VI съезд объединения "Яблоко", в работе которого приняло участие 129 (из 185 избранных) делегатов.
         14 марта было проведено тайное голосование по перевыборам руководящих органов объединения. Его итоги были оглашены на следующий день. За избрание Г.Явлинского председателем объединения проголосовали 127 делегатов съезда ("против" - 5). Первым заместителем председателя вновь избран В.Лукин (120 "за", 12 "против"), заместителями председателя - С.Иваненко (115 "за", 12 "против") и В.Игрунов (80 "за", 53 "против"). Был избран Центральный совет из 42 человек.
         Были внесены изменения в устав. Общероссийское общественное объединение "Яблоко" было переименовано в Общероссийскую политическую организацию "Объединение Яблоко". Для вступающих в нее введен кандидатский стаж (от 6 до 12 месяцев). С 1 марта 1999 запрещается двойное индивидуальное членство в политических партиях и организациях. Другие политические организации могут быть коллективными членами региональных отделений "Яблока" также лишь до 1 марта 1999. Сохранена возможность коллективного членства в "Яблоке" для неполитических организаций.
         Съезд принял резолюцию "О политических задачах ОПОО "Яблоко" ("реализация, по возможности, парламентской процедуры выражения недоверия правительству" - при сотрудничестве с "умеренной и разумной частью правительства" и поддержке "отдельных разумных мер правительственной политики"); "обеспечение эффективной работы избирательной машины, недопущение резких изменений избирательной системы, нарушений и фальсификаций на выборах").
         В резолюции "О социальной политике объединения "Яблоко" сообщалось о начале работы над общефедеральной социальной программой "Вместе мы - сила", для чего Центральному совету поручено сформировать Социальную комиссию.
         В резолюции "Изменить экономическую политику!" предложены следующие меры: "осуществление реальной приватизации, направленной на привлечение инвестиций и эффективное управление, а не на пополнение доходов бюджета и формирование мощнейших монопольных экономических структур"; "ужесточение антимонопольного законодательства и, особенно, практики его реализации", "жесткий контроль за деятельностью естественных монополий", "недопущение разрастания влияния крупнейших финансовых групп на экономические, социальные и политические процессы",
         В резолюции "Об организационных задачах и партийном строительстве" перед объединением ставятся следующие задачи: "завершение преобразования объединения "Яблоко" в политическую партию к осени 1999 г."
         В резолюции "О выборах" ставится задача "отбить беспрецедентное наступление, развернутое силами федеральной бюрократии и регионального сепаратизма на основные принципы системы выборов в Государственную Думу".
               Наиболее важным признано "сохранение паритета при выборах депутатов Государственной Думы по партийным спискам и по одномандатным округам, сохранение 5-процентного барьера". В резолюции "О коалиционной политике объединения на 1998-2000 г." приоритетной для "Яблока" названа "задача создания широкой коалиции демократической оппозиции существующему в России режиму", а стратегическими партнерами ОПООЯ - "оппозиционные демократические партии"; "подлинно независимые профсоюзы и профессиональные ассоциации, а также трудовые коллективы, готовые активно отстаивать свои права перед работодателем в соответствии с законом"; "представители структур местного самоуправления, особенно на его самом нижнем уровне, которого еще не коснулась бюрократизация"; "граждане, объединяющиеся в группы социальной взаимопомощи, обычно причисляемые к так называемому "третьему сектору"; "общества потребителей"; "ассоциации предпринимателей, противодействующие засилью теневой экономики, а также коррупции и произволу чиновников".
         Весной 1998 "Яблоко" отказалось поддержать новое правительство во главе с Сергеем Кириенко и голосовало в Думе против утверждения премьера.
         После отставки С.Кириенко на заседании бюро Центрального совета объединения "Яблоко" 25 августа 1998 было принято единогласное решение не поддерживать кандидатуру В.Черномырдина на пост премьер-министра. В сентябре 1998 "Яблоко" было автором идеи сделать премьер-министром Евгения Примакова. После представления президентом кандидатуры Е.Примакова думская фракция "Яблоко" голосовала за утверждение Е.Примакова, но в состав нового правительства "Яблоко" не вошло - главным образом из-за несогласия с предоставлением коммунисту Юрию Маслюкову поста вице-премьера по экономике (Г.Явлинскому предлагался пост вице-премьера по социальным вопросам).
         Вплоть до вынужденной отставки Е.Примакова "Яблоко", продолжая оказывать доверие лично ему, не поддерживало правительство, критиковало его экономическую политику, голосовало против бюджета, выступало против левых вице-премьеров (Ю.Маслюкова и Геннадия Кулика), выдвигало обвинения в коррупции против некоторых министров и крупных чиновников.
         В 1998 - начале 1999 от "Яблока" фактически отошел депутат Иван Грачев, создавший собственное движение "Развитие предпринимательства".

      В мае 1999 фракция "Яблоко" в Думе голосовала за возбуждение обвинения против президента Ельцина по вопросу о Чеченской войне (начало процесса импичмента). Один депутат (Георгий Садчиков от Ярославской области) голосовал против, несколько человек не взяли бюллетени.
         После отставки правительства Е.Примакова и представлении президентом кандидатуры Сергея Степашина, думская фракция "Яблоко" не принимала решения о солидарном голосовании и депутаты от "Яблока" голосовали по собственному усмотрению (большинство проголосовало за С.Степашина, сам Г.Явлинский не принял участия в голосовании).
         После отправления С.Степашина в отставку в августе 1999 г. 18 депутатов Думы из фракции "Яблоко" голосовали за утверждение нового премьер-министра Владимира Путина (в т.ч. Г.Явлинский), 8 депутатов - против, остальные не голосовали или воздержались.

      На август 1999 года во фракцию "Яблоко" Государственной Думы РФ входило 45 депутатов (помимо избранных от "Яблока", в 1996-99 во фракцию вступили Николай Травкин, Аркадий Янковский, Николай Медведев; в 1996 вышла Светана Гвоздева, в 1998 перестали быть членами "Яблока" вошедшие в правительство В.Черномырдина М.Задорнов и О.Дмитриева, в 1999 году исключен Г.Садчиков и вышли Игорь Лукашев и Ринат Султанов; И.Грачев формально оставался членом фракции до конца второй Думы).

      В конце августа 1999 в союз с "Яблоком" вступил экс-премьер-министр С.Степашин. На VII съезде "Яблока" 27 августа 1999 был утвержден список кандидатов в Думу от "Яблоко", в котором С.Степашин получил 2-е место. С собой С.Степашин привел в список "Яблока" М.Задорнова, а также министра по делам национальностей Вячеслава Михайлова. Первую тройку списка составили Г.Явлинский, С.Степашин, В.Лукин. Федеральный список кандидатов "Яблока" (175 человек) был заверен Центризбиркомом 4 сентября.
         18-19 сентября 1999 прошел второй этап VII съезда. Был утвержден список кандидатов по одномандатным мажоритарным округам, одобрена предвыборная программа "Яблока".
         25 сентября Центризбирком заверил список кандидатов "Яблока" по мажоритарным округам (135 человек).
         15 октября 1999 Центризбирком зарегистрировал федеральный список избирательного объединения "Яблоко" (N6 в избирательном бюллетене) в составе 165 кандидатов.
         19 декабря 1999 "Яблоко" получило по многомандатному федеральному округу 3.955.457 голосов (5,93%, 6-е место) и, соответственно, 16 мандатов по пропорциональной системе. По мажоритарным округам прошли 4 выдвиженца "Яблока", плюс баллотировавшийся как независимый П.Шелищ (итого: 21 мандат). Во фракции "Яблоко" в январе 2000 зарегистрировался 21 депутат.
         15 января 2000 Центральный совет "Яблока", прошедший в Москве 15-16 января 2000, принял решение о выдвижении Г.Явлинского кандидатом на пост президента России инициативной группой граждан (но формально не от "Яблока" - чтобы не созывать дорогостоящий съезд, а также, чтобы выдвижение было не узкопартийным).
         19 января 2000 Г.Явлинский был выдвинут кандидатом в президенты инцииативной группой граждан во главе с Сергеем Ковалевым.
         На президентских выборах 26 марта 2000 Г.Явлинский получил 47.351.452 голосов избирателей (5,80% - 3-е место после В.Путина и Г.Зюганова).
         17 мая 2000 Дума рассмотрела вопрос об утверждении председателем правительства Михаила Касьянова, внесенного президентом В.Путиным. Выступая от имени фракции, С.Иваненко заявил, что "Яблоко" не видит достаточных оснований для поддержки кандидатуры М.Касьянова. Против М.Касьянова проголосовали 8 депутатов фракции (4 - за, 4 - воздержались).

Один член "Яблока" был членом Совета Федерации третьего созыва - Борис Третяк (от законодательной ветви власти Сахалинской области, председатель Законодательного Собрания Сахалинской области в 1996-2000 гг.). До апреля 2000 членом СФ был член "Яблока" Сергей Вахруков (председатель Государственной Думы Ярославской области в 1996-2000).
В Законодательном собрании С-Петербурга второго созыва у "Яблока" после выборов 6-20 декабря 1998 существовала фракция из 7 депутатов (Михаил Амосов - председатель-координатор, Наталья Евдокимова - заместитель координатора, Игорь Б.Артемьев, В.Калинин - заместитель координатора, Алексей Белоусов, Александр Кущак, В.Назаров), сократившаяся к 2002 году до 4 депутатов (М.Амосов, Н.Евдокимова, И.Артемьев, А.Белоусов) и в связи с этим прекратившая формальное существование.

      28-29 октября 2000 в Подмосковье был проведен IX съезд "Яблока". Расширен состав ЦС (за счет представителей провинциальных организаций). Избран новый состав бюро ЦС из 15-ти человек (Г.Явлинский, В.Лукин, Алексей Арбатов, Сергей Иваненко, Вячеслав Игрунов, Сергей Митрохин, Виктор Шейнис, Алексей Захаров, Александр Шишлов, Анатолий Голов, Ольга Покровская, Михаил Емельянов, Игорь Лебедев, Борис Мисник, Александр Чаженгин), избраны 5 секретарей по направлениям работы (С.Митрохин - по идеологии, Игорь Артемьев - по выборам и взаимодействию с оранами власти, Сергей Иваненко - по работе фракции в Думе, Лариса Никулина - по партийному строительству, Александр Кузнецов - по общепартийным проектам).

      21 декабря 2000 Государственная Дума голосовала в первом чтении пакет законов, разрешающий ввоз в Россию на временное хранение или переработку один из видов ядерных отходов - "облученные тепловыделяющие сборки ядерных реакторов", или "отработанное ядерное топливо" (ОЯТ).
         В пакет входили 3 законодательных акта: поправка к статье 50 закона "Об охране окружающей природной среды", категорически запрещавшей ввоз отходов; поправка к закону "Об атомной энергии"; новый закон "О специальных программах экологической реабилитации радиационно-загрязненных регионов РФ, финансируемых за счет поступлений от внешнеторговых операций с облученным ядерным топливом".
         Пакет лоббировался правительством и администрацией президента, соавторами законопроектов были депутаты центристских фракций и КПРФ.
             Против этого закона солидарно голосовала только фракция "Яблоко" (13 - "против", еще 6 не голосовали); вместе с "Яблоком" против пакета голосовали также 8 членов фракции СПС (еще 24 правых депутата не голосовали и 1 проголосовал "за"). Вместе с "Яблоком" против пакета также голосовали двое независимых и еще 14 депутатов других фракций и групп (5 - группа "Народный депутат", 4 - "Единство", 2 - КПРФ, 2 - ЛДПР, 1 - Агропромышленная группа). В итоге пакет о ввозе ядерных отходов был принят конституционным большинством (более 300 голосов).

      14 марта 2001 в государственной Думе по инициативе КПРФ голосовался вопрос о недоверии правительству М.Касьянова. 16 депутатов "Яблока" не приняли участие в голосовании, В.Останин проголосовал "за" недоверие, С.Митрохин воздержался и Е.Мизулина голосовала "против".

      6 июня 2001 фракция "Яблоко" в Государственной Думе солидарно голосовала в третьем, окончательном, чтении против закона о ввозе в Россию ядерных отходов (ОЯТ - "отработанное ядерное топливо"), который был тем не менее принят голосами центристских и большинства левых депутатов (243 - "за", 125 - "против", 7 - воздержались, 75 - не голосовали).

      В мае-июне 2001 года Объединение "Яблоко" было одним из организаторов конференции демократических и правозащитных организаций, образовавших 19 июня 2001 консультационное "Всероссийское Демократическое совещание" (ВДС), в которое вместе с "Яблоком" вошли "Мемориал", СПС, движение "Либеральное Россия", движение "Демократическая Россия", движение "Вперед, Россия!", Партия экономической свободы (ПЭС), партия "Демократический союз России", Социально-экологический союз, Фонд защиты гласности и др.

      Осенью 2001 года из "Яблока" вышел В.Игрунов (оставшийся членом думской фракции). Группа отколовшихся вместе с В.Игруновым бывших "яблочников" создала партию ../partii/slon.html">"Союз людей за образование и науку" (СЛОН).
         14 декабря 2001 фракция "Яблоко" проголосовала за бюджет-2002.

      В Московскую городскую Думу 16 декабря 2001 избраны 4 выдвиженца "Яблока": Евгений Бунимович, Вера Степаненко, Галина Хованская и Валентина Присяжнюк (не член "Яблока") (все 4 входили в т.н. "список 4-х" - за подписью Лужкова, Немцова, Шойгу и Явлинского). Но фактически как минимум двое из депутатов "Яблока" в МГД (Е.Бунивочи и В.Присяжнюк) - в бОльшей степени сторонники мэра Юрия Лужкова, чем своей собственной партии.

      22 мая 2002 в третьем, окончательном чтении Государственная Дума приняла новый закон "Об основных гарантиях избирательных прав и права на участие в референдуме граждан Российской Федерации", который на период избирательных кампаний запрещает совершать "действия, имеющие целью побудить или побуждающие избирателей голосовать за или против кандидатов (списков) или против всех" вне рамок рекламы, оплаченной из зарегистрированных избирательных фондов, - то есть существенно ограничивает конституционное право СМИ (и выступающих в СМИ граждан) высказывать свое мнение. Новый закон предусматривает 13 оснований для отказа кандидатам в регистрации, 4 основания - для аннулирования регистрации решением самого избиркома и еще 6 оснований - для отмены регистрации решением суда по заявлению избирательной комиссии (т.е. легализует т.н. "башкирскую избрательную технологию" - применение административного ресурса для отстранения опасных кандидатов от участия в выборах). За этот закон проголосовали 368 депутатов Государственной Думы из всех фракций, против - не голосовал ни один депутат ГосуДумы, ни из одной фракции. За закон проголосовали 15 депутатов фракции "Яблоко" (в т.ч. Г.Явлинский), не голосовали двое (Михаил Емельянов и Сергей Попов).

Список – 2011

XVI съезд партии, работавший 10-11 сентября 2011, выдвинул список в Госдуму из 374 человек (на момент регистрации – 363) во главе с Григорием Явлинским, Сергеем Митрохиным и член-корром-экологом Алексеем Яблоковым. В десятке также – экс-депутаты Бо-рис Мисник и Александр Шишлов, пермский муниципальный депутат Ольга Колоколова, руководитель фракции «Солдатские матери» Светлана Кузнецова, бизнесмены Анатолий Лейрих (экс-Правое де-ло) и Игорь Николаев, политолог Андрей Рябов. Был выдвинут, но снял свою кандидатуру главный редактор «Новой газеты» Дмитрий Муратов. Санкт-Петербургскую группу возглавляет журналист «Новой газеты» Борис Вишневский, на невысоком месте в одной из москов-ских групп – Юлия Калинина (журналистка МК). Правозащитник Сер-гей Ковалёв – на 11-м месте в Мордовско-Пензенско-Ульяновской группе. Экс-мэр Архангельска Александр Донской был включён в список, но затем исключён из него за то, что скрыл от партии раннюю судимость за грабёж.